在真實(shí)組織環(huán)境中對(duì)細(xì)胞進(jìn)行原位分析

原位分析

Xenium原位分析技術(shù)直接檢測并保留組織切片中數(shù)百個(gè)RNA靶點(diǎn)的細(xì)胞定位，無需常規(guī)測序技術(shù)輔助。這為研究人員提供了一張?jiān)敿?xì)的基因表達(dá)模式圖，且無需犧牲分辨率或靶點(diǎn)數(shù)量。

Xenium原位分析技術(shù)使用針對(duì)靶點(diǎn)基因特異性的可環(huán)化探針和目標(biāo)RNA雜交，再通過環(huán)狀探針原位滾環(huán)擴(kuò)增，擴(kuò)增可供熒光標(biāo)記探針雜交的基因特異性空間標(biāo)簽序列。在Xenium分析儀上進(jìn)行多輪熒光標(biāo)記探針的雜交，每一輪雜交反應(yīng)中，熒光標(biāo)記探針和基因特異性空間標(biāo)簽序列雜交，通過高分辨率顯微鏡掃描圖像，檢測每個(gè)熒光探針的位置，然后將熒光探針移除。連續(xù)幾輪的熒光探針雜交、成像和移除會(huì)在每一個(gè)特定探針雜交的位置產(chǎn)生熒光顏色“開"關(guān)模式，并而形成熒光信號(hào)組合特征條形碼，揭示組織中每個(gè)細(xì)胞內(nèi)每個(gè)位置的RNA身份信息。未來，Xenium還能夠檢測同一組織切片中的RNA和蛋白質(zhì)表達(dá)水平，從而實(shí)現(xiàn)組織中復(fù)雜而精準(zhǔn)的表達(dá)模式分析。

通過Xenium原位分析來構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜。將新鮮冷凍或FFPE組織切片放在Xenium玻片上。對(duì)切片進(jìn)行處理，獲取RNA后用可環(huán)化的基因特異性DNA探針進(jìn)行標(biāo)記。接著，探針連接后產(chǎn)生可酶促擴(kuò)增的環(huán)狀DNA探針。將玻片置于Xenium分析儀內(nèi)進(jìn)行多輪的熒光探針的雜交、成像、解碼和數(shù)據(jù)處理。

應(yīng)用范圍和研究領(lǐng)域

Xenium原位分析技術(shù)，幫助研究人員能夠確定細(xì)胞在其原始組織中的特定位置的基因、蛋白表達(dá)模式，獲取詳細(xì)的空間信息，該技術(shù)將助力多個(gè)重要應(yīng)用領(lǐng)域的研究快速發(fā)展，包括：

腫瘤學(xué)

揭示腫瘤和免疫微環(huán)境中異質(zhì)性的空間特征，并確定具有潛在治療影響的生物標(biāo)志物。

免疫學(xué)

表征免疫系統(tǒng)和空間定位如何應(yīng)答傳染病、過敏性炎癥和自身免疫性疾病。

神經(jīng)科學(xué)

揭示復(fù)雜神經(jīng)組織中應(yīng)對(duì)疾病和創(chuàng)傷的空間表達(dá)模式。

產(chǎn)品規(guī)格